年幼的愛力克兄弟十分思念去世的母親，不惜觸犯煉金術中最大的禁忌，進行了人體煉成。可是煉成失敗了，哥哥愛德華失去了左腿，弟弟阿爾馮斯失去了肉體，哥哥拼命用自己的右臂為代價也只能把弟弟的靈魂附身在壹副鎧甲上。為了償還他們自己的罪，找回失去的壹切，兄弟二人踏上了尋找傳說中的“賢者之石”的旅程。 

       幾年後，壹位右臂與左腿都是由“機械鎧甲”替代的國家煉金術士出現在人們的眼前，他被稱作“鋼之煉金術師”。